بر اساس اظهارات همراهان وی، آقای غفاری صبح روز یکشنبه پنجم خرداد ماه به عنوان پاره اي مذاكرات توسط کمیته مشترک وزارت اطلاعات وحراست درمانگاه وكلينيك سید الشهداء صلوات الله علیه در گلوبندک تهران إحضار ميشود. دستورکار جلسه براساس ادعای مأمور وزارت اطلاعات، مذاکره پیرامون وضعیت درمانگاه  توسط وزارت اطلاعات عنوان می شود.

ساعاتی پس از ورود ایشان به درمانگاه سید الشهداء، درکمال شگفتی با خانواده ایشان تماس گرفته شده وخبر مرگ وي را اعلام وجهت تحويل جسد خانواده وبستگان را دعوت ميكنند. براساس گزارش از پیش تنظیم شده در درمانگاه، علت مرگ وی سکته قلبی عنوان شده است.

این درحالیستکه بنا به اظهارات خانواده ونزدیکان وی، ایشان هیچ گونه سابقه وپیشینه بیماری قلبی نداشته واز هیچ بیماری خاصی هم رنج نمی برد.

درمانگاه سیدالشهداء علیه السلام در نوع خوداز درمانگاهاي  مجهز تهران بود که حاج محمد غفاری بادستور مرجع فقید آیت الله سید محمد شیرازی رضوان الله تعالی علیه وهمت اهل خير وكمك هاي صرفا مردمي در آذر ماه 1360 آنرا تأسیس نمود.

این درمانگاه بعدها ودرآغازین سال زمامداری علی خامنه ای وهمزمان با تشدید فشارهای رژیم مطلقه ایران بر مرجع فقید آیت الله العظمی سید محمد شیرازی به علت عدم تأیید مرجعیت ورهبری آقای خامنه ای،  توسط نیروهای وزارت اطلاعات مصادره وتصرف شد.

مصادره این درمانگاه بخشی از پروژه مصادره پروژه های بیت شیرازی از جمله حسینیه کربلاییهای تهران وقم وهمچنین مسجد امام زین العابدین صلوات الله  وسلامه علیه در قم ودهها پروژه وطرح خدماتی ومذهبی دیگر بود.

پس از مصادره درمانگاه  سید الشهداء صلوات الله وسلامه علیه، حاج محمد غفاری (ابوكمال) در سال ١٣٧٤ توسط نیروها وزارت اطلاعات دستگیر وروانه زندان شد ودرآنجا بشدت تحت انواع شکنجه  ها قرار گرفت، آنچنانکه بنا بر اظهارات نزدیکان ایشان، آثار شکنجه تا روز شهادت نیز همراه ایشان بود.

پس از آزادی از زندان، طی 18 سال گذشته، شهید حاج محمد غفاری تلاشهای گسترده ای را برای بازپس گیری درمانگاه سید الشهداء علیه السلام از وزارت اطلاعات رژیم مطلقه دنبال ميكرد، تلاشهایی که با تهدید های مکرر وزارت اطلاعات مبنی بر حذف وقتل وی همراه بود وبنابر اظهارات برخي نزديكان ایشان، اين تهدیدها دربرخی مقاطع روزانه چند بار واز طرف نهادهای مختلف تکرار می شد. تهدیدهایی که با مصادره اموال ودارایی های ایشان وسپس ممنوع الخروج ساختن وی آغاز شد ودرنهایت به ترور ناجوانمردانه وخاموش در روز گذشته منجر شد.

به نظر می رسد با پیگیری های مکرر شهید حاج محمد غفاری برای بازپس گیری درمانگاه، درنهایت عوامل رژیم مطلقه تصمیم به حذف وقتل وی گرفتند.

البته طی سالهای گذشته قتل روحانیون وچهره های مذهبی واجتماعی نزدیک به بیت آیت الله العظمی شیرازی از یک سو وترور حامیان مالی واقتصادی پروژه های بیت آیت الله شیرازی درکنار مصادره أموال وموسسات خيريه وعام المنفعه كه با توليت و سرپرستي اين مرجعیت منتقد رژیم مطلقه ایران اداره ميشود، سه ضلع برخورد خشونت آمیز با بیت آیت الله العظمی شیرازی بوده اند.

شهادت آیت الله سید محمد رضا شیرازی مهمترین ترور اجرا شده توسط رژیم مطلقه ایران بود که شش سال قبل ضربه سنگینی را به بیت شیرازی ومرجعيت شيعه وجهان اسلام وارد ساخت.

پس از آن ترور خاموش چهره های برجسته وموثر از طیف شیرازی مانند حجت الإسلام والمسلمين خورشیدی، حجة الإسلام محمود قانعی، حجة الإسلام  فاضل فراتی ودیگرانی از این قبیل یکی از پس دیگری نشان داد که رژیم مطلقه فقیه بنای برخورد فیزیکی وحذف نخبگان طیف شیرازی ودرنهایت تضیعیف مرجعیت ایشان را دارد.

ترور شهید حاج محمد غفاری نشان دهنده آنستکه  این روزها درکنار طرح حذف چهره های معروف ومؤثر مذهبي وتبليغی بیت شیرازی، ترور چهره های مالی وحامیان اقتصادي طیف شیرازی باردیگر به جریان افتاده وبطور جدی درحال اجراست.

پیش از این نیز رژیم مطلقه ایران ودرمواردی مشابه اقدام به قتل وحذف کارگزاران ونزدیکان بیت آیت الله العظمی شیرازی ازجمله شهید عباس عاملیان، شهید سید تقی مستجاب الدعوه وشهید حاج محمد پوردارا نموده بود. ودر مواردي مثل مسموميت ايت الله سيد مهدي امامي وحجة الإسلام والمسلمين سياح اين ترورهاي خاموش زنجيره اي ناكام ماند.