در تاریخ پنجم خرداد ماه 1392، حجت الاسلام والمسلمین هنرور شجاعی بدون اعلام قبلی وقت دادگاه و امکان اطلاع  از کیفرخواست صادره، و بدون امکان گرفتن وکیل، یا تهیه لایحه، به شعبه سه دادگاه ویژه روحانیت تهران فراخوانده شد و مورد محاکمه قرار گرفت.

هنرورشجاعی نخست به عدم تعیین وقت دادگاه و عدم اطلاع از کیفرخواست که خلاف صریح ماده 190 قانون آئین دادرسی کیفری است، اعتراض نمود. در این رابطه قاضی پیشنهاد استمهال و تجدید جلسه دادگاه داد ولی هنرور شجاعی ترجیح داد که در همین جلسه به دفاع بپردازد، وی به اتهامات: توهین به آیت الله خمینی، تبلیغ علیه نظام، نقض حکم خلع لباس روحانیت و"اضلال و گمراه نمودن و به ارتداد کشاندن مردم از طریق نقد ولایت فقیه"، محاکمه شد.